Początki Mszy świętych dla wspólnoty afrykańskiej sięgają roku 2018. Wspólnotę afrykańską tworzą przeważnie studenci z różnych krajów afrykańskich między innymi z Rwandy, Senegalu, Angoli, Madagaskaru, Togo, Gabonu, Burundi. Msze afrykańskie odbywają się w każdą niedzielę o 15:00 w kaplicy pod kościołem. Duszpasterzami wspólnoty afrykańskiej są ojciec Eric Hounake, werbista i ojciec Benoit Azameti, misjonarz kombonianin, również pochodzący z Togo oraz księża studenci UKSW pochodzący z Afryki. Oprócz niedzielnych mszy święty, odbywają się Msze i spotkania dla poszczególnych grup narodowościowych, np. Msze święte dla wspólnoty Rwandyjczyków i dla studentów z Zimbabwe. Wspólnota stanowi nie tylko miejsce modlitwy, ale i również miejsce spotkania i wsparcia dla studentów z Afryki.